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全及&ldo;國家&rdo;建設大政方針。

&ldo;國防部&rdo;隸屬於&ldo;行政院&rdo;，主管&ldo;國防&rdo;行政事務，負責軍隊人事安排、組織編制、軍費預算、武器研製與採購、軍隊設施建設等。&ldo;參謀本部&rdo;為最高軍事指揮機構，&ldo;參謀總長&rdo;在軍令系統為&ldo;總統&rdo;的軍事幕僚長，掌握軍隊指揮大權；在軍政系統上同時又為&ldo;國防部長&rdo;的幕僚長。&ldo;參謀本部&rdo;下轄陸軍、海軍、空軍、聯勤、憲兵、海岸巡防及軍管區司令部。陸、海、空軍總司令部等依據軍隊的建軍方針及原則，擬訂本軍種的建設規劃和作戰計劃，戰時組織指揮戰鬥行動，平時組織部隊訓練。臺軍還設有總政治作戰部，並在軍隊各級單位設有相應機構，主要負責對官兵的思想教育和部隊的內部控制，以及對大陸進行&ldo;心戰&rdo;策反。

李登輝主政後，一直醞釀改革現行軍事體制，擬將以前的軍政、軍令二元化軍事體制改為一元化。1998年5月21日，臺灣&ldo;行政院&rdo;透過了&ldo;國防法&rdo;草案及&ldo;國防部組織法&rdo;修正草案。2000年1月29日，《國防法》、《國防部組織法》正式公佈，並由&ldo;國防部&rdo;組成&ldo;國防組織規劃委員會&rdo;，在規定的三年時間內，推動軍事體制的改革。2000年底，與之配套的《參謀本部組織條例》又透過立法。2002年3月1日，&ldo;國、防二法&rdo;正式實行，新的&ldo;軍政、軍令、軍備&rdo;三大系統一元化的軍事體制至此完全確立。

新的體制架構，實行軍政、軍令一元化，即&ldo;國防部長&rdo;由文人擔任，為&ldo;總統&rdo;的軍事幕僚長，&ldo;總統&rdo;透過&ldo;國防部長&rdo;行使統帥權指揮三軍。而&ldo;參謀總長&rdo;為&ldo;國防部長&rdo;的軍事幕僚長，&ldo;參謀本部&rdo;為&ldo;國防部長&rdo;的軍事幕僚及三軍聯合作戰指揮機構；&ldo;參謀本部&rdo;改稱&ldo;國防部參謀本部&rdo;；原隸屬&ldo;參謀本部&rdo;的各軍兵種司令部等改為直接隸屬於&ldo;國防部&rdo;，必須在陸、海、空軍總司令部和聯合後勤司令部、後備司令部、憲兵司令部前加上&ldo;國防部&rdo;三個字。&ldo;總統&rdo;對軍隊行使統帥權時，將直接下令&ldo;國防部長&rdo;，由&ldo;國防部長&rdo;責成&ldo;參謀總長&rdo;指揮軍隊。

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