第456章 哲學的眼光
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第二天,陸時羨帶著陳依依在耶魯大學逛了一圈,一起吃過午餐,便把她送上了回洛杉磯的飛機。
等再次回到公寓的時候,已經是月明星稀。
結束了一天的導遊工作,陸時羨洗了個澡,倒下便睡。
當他再次清醒的時候,已經是上午九點。
這和他固有的生物鐘是極不相符的,但也能看出他最近真的透支太多了。
這次倒是可以好好休息一下。
當他租住這間單人公寓的時候,是有設計一個書房的。
但現在看來,當時的設想似乎做了無用功,自從進了實驗室,他都沒有多少時間踏入其中。
單人公寓的作用僅僅只是一個宿舍而已。
乘著和煦的陽光,陸時羨興起拿起一本《蟻丘》,從序言看到湖畔的初次探險。
即使原野一次次地被燒盡,蟻丘始終都會活下來,它向荒原提供營養,也向荒原上的新草講述舊年的災情。
愛德華·威爾遜是那種極少的文筆極好的生物學家,在他筆下構建了一個完全由螞蟻構建的世界,揭示了一個微觀世界中的生態系統和社會結構。
可惜,他的時間並不足以將這本書細細品味一遍,只是心中不斷暗歎,果然能夠開創一個學科的大佬所擁有的思想深度還是目前的他所不能觸及的。
下午,陸時羨準時出現在實驗室裡。
而其餘幾人也陸陸續續地抵達,最後會和到一起。
看著梅林、瑟琳和鮑勃幾人的精神狀態好了許多,陸時羨點點頭,開口說道:”大家應該都休息好了,現在是時候大幹一場了。”
這個過程非常繁瑣,特別是對植物基因組而言,因其包含有大量的基因和非編碼區域,導致處理工作複雜。
陸時羨將目光投向三人:“怎麼樣?進行處理的詳細步驟應該不用我說了吧,接下來我說一下初步安排。”
看著幾人點點頭,他繼續說道:”第一步序列質量控制鮑勃你來,而第一步基因註釋工作量也比較大,由我和梅林一起來做,瑟琳你來進行第三步的基因表達分析。”
“大家有沒有問題?”
聽到這幾句話,三人都搖搖頭。
事實上,他的安排是比較合理的。
沒有人能保證在測序過程中不存在任何錯誤,哪怕只是一點誤差就會對測序結果帶來干擾。
然後連帶著對後續資料分析與處理造成巨大的影響,因此對序列資料進行質量控制是減少誤差影響的必要環節。
當然,這個工作對鮑勃而言並不難的,他的生物資訊學課程掌握的還是比較紮實的,對序列比對、K-mer分析、Gc含量分析等方法並並不陌生。
而基因註釋是進行資料處理的關鍵環節,就如它字面上的意思一樣,是對基因組序列中的基因和非編碼序列進行識別和註釋。
進行這個工作要麼需要對比較基因組學具有比較熟悉的瞭解,透過已知物種中的基因和基因組結構相似性來找到植物基因組中的相似序列。
要麼在實驗資料處理上具有極高的水準,能夠利用RNA-Seq和別的專業實驗資料來確定基因位置和剪接模式。
兩者工作過程看似截然不同,但最後殊途同歸。
基因表達分析是用來評估植物基因組序列中的基因在不同的生長發育階段或者是在不同環境條件下的表達級別。
可以運用差異表達分析、功能分析和通路分析等方法來幫助他們深入瞭解植物基因的功能和在它們在生長發育和環境響應中的作用機制。
處理基因測序資訊資料的工作實際上是屬於生物資訊學的範疇。
其實目前生物資訊學能夠逐漸發展為一
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