第468章 大基因組組裝
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“對於二代測序NGS技術,在座的各位都已經瞭如指掌。目前可供選擇的並不算多,特別是Illumina測序,憑藉著高通量、低成本,已經逐漸變成主流。”
“但隨著需求的變化,相信大家都能體會到,二代的讀長實在太短,常規模式只能測pE150的長度。在這樣的背景下,三代測序技術應運而生。”
此句說完,下面不少人都跟著點頭,顯然深有體會。在這裡聽報告的,不說全部都是做研究的教授學者,但起碼都是相關從業人員。
陸時羨沒說什麼虛頭巴腦的東西,只有真正上手操作過測序工作才能切身體會到。
“小陸說的確實是實話,不過就目前而言,讀長短的劣勢可以運用軟體演算法進行最佳化改良,最後呈現出來的效果也還算不錯。”臺下顧洪雅教授小聲地說出了多數人心中的想法。
沒有人不怕麻煩,到了一定的年齡,人們探索新事物的動機就會下降,改為以經驗來看待事物,這樣就容易過於依賴經驗,滿足於用老經驗老方法來解決問題。
這也就是原來的東西只要還能用,幾乎沒人願意花費大量精力去學習的原因。
話雖然這麼說,但沒人去反駁和打斷陸時羨。
成功者掌握話語權。
人家都用三代測序在基因重組上作出了新突破,併成功在頂刊上發表了,那肯定是你說什麼就是什麼。
顯然,這個時候要想引人注目,就必須得畫一個好看並且誘人的大餅。
於是陸時羨開始了他的畫餅操作。
“首先,我先介紹一下我在耶魯大學時的研究內容。\"
“眾所周知,三代測序技術的實質是無需進行pcR擴增操作,實從而現對每一條dNA分子的單獨測序。基於第三代測序技術的這個特點,我們透過有效基因具備的特殊編碼——起始密碼子、終止密碼子,以及編碼基因序列特徵,組裝了數十個樣本和水稻的高質量基因組,繪製了首個芒屬基因組變異圖譜,構建了世界第一個高質量圖基因組。“
“然後我們透過系統發育和比較基因組學手段瞭解到這種植物遠緣雜交後的基本情況,解析了這個過程中的基因組變異過程。與此同時,我們根據基因組變異和水稻的表型組資料關聯,發掘出許多與表型顯著關聯的重要性狀相關位點,如控制葉綠素合成性狀的穀氨酸-1-半醛轉氨酶(GSAAt)基因等......“
“另外,正是透過這個實驗,我們真正瞭解到一種遠緣雜交植物的基因變異和物種進化過程。因為兼具芒屬和蘆竹屬的特點,後來我將其命名為歐洲蘆芒,目前已經在國際植物命名法規上註冊。”
陸時羨花了不到五分鐘的時間將之前發表在Science上的成果簡單報告了一下。
而現場也不復之前的平靜,開始有一些討論聲出現。
不懂行的人,會覺得發現一個新物種並且給它起了一個國際通用的名字,這實在太酷啦!
而懂行的業內人士,思考的是這種方法在其他物種、甚至是其他領域的可能性,他們敏銳地感覺到這個技術的可塑造和發展性。
不愧能夠登上Science的封面文章,它有廣闊的未來。
陸時羨剛剛所說的部分,實際上這才算此次報告的開胃菜而已,他還有更大的乾貨即將拿出來,也即將解答這些人的疑問。
“下面我將在這份成果的基礎上,做些許延申和展望。裡面的許多內容都是我個人的一些想法,還未經過實驗證實,但它仍代表著我對三代測序技術未來發展方向的看法。”
陸時羨按動手裡的遙控器,大螢幕上的ppt開始切換,最後顯現出幾個大字。
【大基因組組裝】
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